SPO Transport jest jednym z  siedmiu programów operacyjnych służących realizacji Narodowego Planu Rozwoju / Podstaw Wsparcia Wspólnoty (NPR/CSF) na lata 2004-2006. Program ten wraz z częścią transportową strategii dla wykorzystania Funduszu Spójności, rozwija cele PWW, określając kierunki, priorytety, działania i wysokość środków przeznaczonych na rozwój sfery transportu i gospodarki morskiej.

Celem strategicznym SPOT jest zwiększenie spójności transportowej kraju oraz polepszenie dostępności przestrzennej miasta, obszarów i regionów Polski w układzie Unii Europejskiej.

Cele SPO Transport są realizowane poprzez trzy Priorytety:

1. Priorytetu 1: Zrównoważony gałęziowo rozwój transportu.
   Priorytet pierwszy ma na celu strukturalne i gałęziowe zrównoważenie polskiego transportu poprzez znalezienie alternatywy dla zbyt intensywnego rozwoju transportu drogowego m.in. wspierając rozwój atrakcyjnej oferty przewozów kolejowych, morskich i intermodalnych.
   W ramach tego priorytetu będą realizowane trzy cele cząstkowe:
   
   
   • Cel pierwszy to modernizacja linii kolejowych pomiędzy aglomeracjami miejskimi i w aglomeracjach miejskich, w tym również budowa metra w Warszawie oraz doposażenie przewoźników w nowoczesny tabor kolejowy.
     
     
   • Cel drugi to poprawa infrastruktury dostępu do portów morskich, obejmująca infrastrukturę dostępu od strony morza, infrastrukturę portową i infrastrukturę dostępu od strony lądu. Posłuży to do polepszenia konkurencyjności transportu morskiego, a zwłaszcza żeglugi bliskiego zasięgu.
     
     
   • Cel trzeci to rozwój infrastruktury systemów intermodalnych. Zakłada on realizację działań służących zwiększeniu przewozów ładunków transportem intermodalnym w relacjach pomiędzy transportem kolejowym i innymi gałęziami transportu oraz transportu morskiego z pozostałymi gałęziami transportu. Wsparciem objęte zostaną, w ramach tego celu, rozbudowa centrów logistycznych (kolejowych i w portach morskich) oraz terminale transportu intermodalnego na sieci kolejowej.
     
     
2. Priorytetu 2: Bezpieczniejsza infrastruktura drogowa
   Priorytet ten dotyczy zapewnienia bezpieczeństwa w polskim transporcie. Zapisy dotyczące bezpieczeństwa w transporcie znajdują się zarówno w traktacie Maastricht, jak i w Białej Księdze Komisji Europejskiej dotyczącej polityki transportowej do roku 2010. Zmniejszenie liczby ofiar śmiertelnych oraz wykorzystanie nowoczesnych technologii poprawy bezpieczeństwa ruchu drogowego, są jej priorytetowymi zagadnieniami. W ramach tego priorytetu będą realizowane trzy cele cząstkowe:
   
   
   
   • Za cel pierwszy przyjęto budowę autostrad i dróg ekspresowych, przebudowę oraz modernizację dróg krajowych, polegającą na przystosowaniu nawierzchni dróg i mostów do nacisków 11,5 T/oś – począwszy od dróg sieci TEN-T oraz innych dróg o dużym ruchu samochodów ciężarowych.
     
     
   • Cel drugi to usprawnienie przejazdów przez miasta na prawach powiatu. Będzie on realizowany przez budowę obwodnic miast oraz usprawnienie przejazdów drogami krajowymi przez miasta na prawach powiatu. Warunkiem skutecznej realizacji tego celu jest ścisła współpraca zarządcy dróg krajowych z samorządami terytorialnymi.
     
     
   • Cel trzeci dotyczy wdrożenia i monitoringu środków poprawy bezpieczeństwa na drogach krajowych. Będzie on realizowany przez: likwidację miejsc niebezpiecznych; zapewnienie odpowiedniego oznakowania, wyposażenia i informacji; wspieranie ratownictwa na drogach krajowych; rozwój systemu zarządzania ruchem oraz systemów poprawy bezpieczeństwa ruchu; poprawę skuteczności działań prewencyjnych Policji w zakresie ruchu drogowego.
     
     
3. Priorytetu 3: Pomoc techniczna dla SPOT
   Celem pomocy technicznej jest zapewnienie wsparcia dla wdrażania SPOT. Pomoc techniczna zostanie przeznaczona na dwa działania:
   
   
   
   • Wsparcie efektywnego zarządzania SPOT, w tym zatrudnienie personelu i zakupu sprzętu komputerowego oraz oprogramowania, usługi dla personelu zaangażowanego we wdrażanie SPOT, szkoleń w ramach zarządzania projektami SPOT dla pracowników MT i MRR oraz dla pracowników beneficjentów zaangażowanych we wdrażanie SPOT, wymiany doświadczeń między personelem zaangażowanym we wdrażanie SPOT w kraju a personelem innych krajów członkowskich Unii Europejskiej,
     
     
   • Wsparcie kampanii informacyjnej promującej SPOT, strony internetowej promującej SPOT, zapewnienia w ramach promocji i informacji SPOT szkoleń dla pracowników MT oraz MRR.