19 lutego 2008 r. wiceminister rozwoju regionalnego Krzysztof Hetman podpisał umowę z Fundacją „Fundusz Współpracy” w sprawie utworzenia i funkcjonowania Wspólnego Sekretariatu Technicznego dla Programu Współpracy Transgranicznej Południowy Bałtyk 2007-2013.

Program Współpracy Transgranicznej Południowy Bałtyk jest realizowany przez pięć państw: Polskę, Danię, Litwę, Niemcy oraz Szwecję. Rolę Instytucji Zarządzającej Programem pełni minister rozwoju regionalnego.

Wspólny Sekretariat Techniczny będzie wspierał Instytucję Zarządzającą w realizacji następujących zadań: 

• promowanie i zapewnianie informacji o Programie i jego celach;
• zapewnianie pomocy i doradzanie potencjalnym beneficjentom Programu;
• przyjmowanie i rejestrowanie wniosków dotyczących projektów;
• ocena przedłożonych wniosków;
• przygotowywanie posiedzeń Komitetu Monitorującego i Komitetu Sterującego oraz zapewnianie im odpowiedniej dokumentacji;
• pomoc we wdrażaniu Programu, jak również w jego monitorowaniu oraz inne.

Wspólny Sekretariat Techniczny utworzony będzie w strukturach Fundacji „Fundusz Współpracy”, mającej wieloletnie doświadczenia we wdrażaniu szeregu programów pomocowych dla Polski m.in. współfinansowanych ze środków Unii Europejskiej.

Zgodnie z porozumieniem pomiędzy państwami członkowskimi uczestniczącymi w Programie Wspólny Sekretariat Techniczny ulokowany będzie w Gdańsku, a jego pracownicy pochodzić będą z krajów uczestniczących w Programie.

26 marca 2008 r. w Gdańsku odbędzie się konferencja otwierająca Program Współpracy Transgranicznej Południowy Bałtyk. Tego samego dnia rozpocznie się nabór wniosków o dofinansowanie, który został przewidziany na okres 26 marca – 30 kwietnia 2008 r.