25 lutego 2008 r. wiceminister rozwoju regionalnego Krzysztof Hetman podpisał umowę z Fundacją „Fundusz Współpracy” w sprawie utworzenia i funkcjonowania Wspólnego Sekretariatu Technicznego dla Programu Współpracy Transgranicznej Rzeczpospolita Polska – Republika Słowacka 2007-2013.
Program Współpracy Transgranicznej Rzeczpospolita Polska – Republika Słowacka obejmuje:
- po polskiej stronie podregiony (NTS III): bielsko-bialski, nowosądecki, krośnieńsko-przemyski oraz NTS IV: powiat oświęcimski (podregion krakowsko-tarnowski – NTS III), powiat pszczyński (podregion centralny śląski – NTS III), powiat rzeszowski oraz powiat grodzki Rzeszów (podregion rzeszowsko-tarnobrzeski – NTS III)
- po słowackiej stronie regiony (NTS III): Kraj Žilinský oraz Kraj Prešovský
Rolę Instytucji Zarządzającej Programem pełni minister rozwoju regionalnego.

Wspólny Sekretariat Techniczny będzie wspierał Instytucję Zarządzającą w realizacji następujących zadań:
- promowanie i zapewnianie informacji o Programie i jego celach;
- zapewnianie pomocy i doradzanie potencjalnym beneficjentom Programu;
- przyjmowanie i rejestrowanie wniosków dotyczących projektów;
- ocena przedłożonych wniosków;
- przygotowywanie posiedzeń Komitetu Monitorującego oraz zapewnianie jego obsługi (w tym odpowiedniej dokumentacji);
- pomoc we wdrażaniu Programu, jak również w jego monitorowaniu oraz inne.
Wspólny Sekretariat Techniczny utworzony będzie w strukturach Fundacji „Fundusz Współpracy”, mającej wieloletnie doświadczenia we wdrażaniu szeregu programów pomocowych dla Polski m.in. współfinansowanych ze środków Unii Europejskiej.
Zgodnie z porozumieniem pomiędzy państwami członkowskimi uczestniczącymi w Programie Wspólny Sekretariat Techniczny ulokowany będzie w Krakowie, a jego pracownicy pochodzić będą obu z krajów uczestniczących w Programie.
***
22 kwietnia 2008 r. w Krakowie odbędzie się konferencja otwierająca Program Współpracy Transgranicznej Rzeczpospolita Polska – Republika Słowacka oraz otwarcie naboru wniosków o dofinansowanie w ramach Programu.